Berdasarkan Peraturan Menteri Kesehatan Republik Indonesia Nomor 356/Menkes/Per/IV/2008 tentang Organisasi dan Tata Kerja Kantor Kesehatan Pelabuhan sebagaimana yang telah diubah terakhir dengan Peraturan Menteri Kesehatan Republik Indonesia Nomor 2348/Menkes/Per/XI/2011, wilayah kerja Balai Kekarantinaan Kesehatan Kelas I Pontianak meliputi:
| No | Tempat Kedudukan | Alamat | Nama Kepala |
|---|---|---|---|
| 1 | Balai Kekarantinaan Kesehatan Kelas I Pontianak (Induk) | Jalan Soekarno Hatta / Arteri Supadio KM 18 Kubu Raya 78391 | Jalan Soekarno Hatta / Arteri Supadio KM 18 Kubu Raya 78391 |
| 2 | Bandara Internasional Supadio (Wilayah Kerja - Bandara) | Jalan Arteri Supadio Km. 17, Kec. Sungai Raya, Kabupaten Kubu Raya | dr. KIBLAT PUSPA VIJAYA, S.E, M.K.K. |
| 3 | Pelabuhan Laut Ketapang (Wilayah Kerja - Pelabuhan) | Suka Bangun, Delta Pawan, Kabupaten Ketapang | dr. RIRI FATMA |
| 4 | Pelabuhan Laut Kendawangan (Wilayah Kerja - Pelabuhan) | Jalan Rahadi Usman No.1, Kendawangan Kiri, Kec. Kendawangan, Kabupaten Ketapang | MUJI UTOMO |
| 5 | Pelabuhan Laut Padang Tikar (Wilayah Kerja - Pelabuhan) | Kec. Batu Ampar Kabupaten Kubu Raya | ABINAWA ASOTJA, SKM |
| 6 | Pelabuhan Dwikora Pontianak (Wilayah Kerja - Pelabuhan) | Jalan Pak Kasih, Gg. Merak III Block C No.1-2, Mariana, Pontianak Kota | RHEZKA IMANIAR FITRANTO, SKM |
| 7 | Pelabuhan Terminal Kijing Pelabuhan Pontianak Sungai Kunyit | Jl. Tj. Sanggau, Sungai Kunyit Laut, Sungai Kunyit, Kab. Mempawah, Kalimantan Barat 78371 | SUHARNO, SKM |
© Balai Kekarantinaan Kesehatan Kelas I Pontianak